《明日方舟》的故事在名為「泰拉」的虛構大陸中，居住在泰拉的人類都是具有動物特徵的亞人類，是否存在純正的「人類」還不得而知。

時間背景為近代末日，各地發生著天災還有傳染病，除了現代科技的發展（有機器人、大型船艦、現代化高樓）之外，還發展著「源石技藝」推動科技的發展。

【天災】泛指各種自然的巨大災害（如風災、地震、隕石墜落等），是文明的大敵。在毀滅的同時，天災也帶來了「源石」。

【源石】一種自然界能量結晶形成的神秘礦石。在帶來現代文明的進步的同時，源石外洩的物質也催生了礦石病的產生。

【礦石病】會在體內擴散源石結晶，最終使人完全結晶化。傳染方式包括被源石劃破皮膚、進入高濃度源石污染的地區，跟患者一同說話用餐是不會被傳染的，只是可能透過接觸血液中或是體表的源石結晶而受感染。

【感染者】泛指「礦石病」的患者。目前沒有辦法被治癒。在患者死亡全身結晶化後會粉碎擴散，這時才成為感染源。存在著許多對感染者有著詬病和偏見的人。

【源石技藝】使用源石驅動來辦到各式各樣的事，簡單一點可以理解為類似「魔法」。非感染者必須倚靠施術單元施放源石技藝，感染者則可直接施放。源石技藝的強度和使用者本身水平和適應性有極大關聯，想要強大的源石技藝必須要有天賦＋熟練程度。

【羅德島】本文件的黑鍵和甜音目前所屬的組織。全稱羅德島製藥公司，本體為名為羅德島號艦的大型海上船艦，在全大陸各地設有分部。混合了感染者成員在內，擁有完整獨立武裝力量與礦石感染研究與檢疫手段的組織，成為了近期活躍在處理感染者暴亂問題最前線的小型組織。以找到治癒感染者的方法，尋找讓感染者與普通人和平共處之路為組織核心目標。

【萊塔尼亞】本文件的黑鍵和甜音出身的國家。歷史原型為奧匈帝國二元君主制國家，以古典文化、音樂藝術而聞名。泰拉世界「新文化」的發源地之一，嚴謹和浪漫是萊塔尼亞的代名詞。主要種族為卡普里尼（羊亞人）以及埃拉菲亞（鹿亞人），也存在著其他種族但數量不多。重視源石技藝的發展，將源石技藝列為必修課，大學中也有相關專業課程。